slickScore.h

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00001 // $Id: slickScore.h,v 1.2 2006/05/21 18:15:29 anker Exp $
00002 
00003 #ifndef BALL_SCORING_FUNCTIONS_SLICKSCORE_H
00004 #define BALL_SCORING_FUNCTIONS_SLICKSCORE_H
00005 
00006 #ifndef BALL_COMMON_H
00007 # include <BALL/common.h>
00008 #endif
00009 
00010 #ifndef BALL_MOLMEC_COMMON_FORCEFIELD_H
00011 # include <BALL/SCORING/COMMON/scoringFunction.h>
00012 #endif
00013 
00014 #ifndef BALL_KERNEL_SYSTEM_H
00015 # include <BALL/KERNEL/system.h>
00016 #endif
00017 
00018 #ifndef BALL_DATATYPE_HASHMAP_H
00019 # include <BALL/DATATYPE/hashMap.h>
00020 #endif
00021 
00022 namespace BALL 
00023 {
00027   class SLICKScore
00028     : public ScoringFunction
00029   {
00030 
00031     public:
00032 
00036 
00039     struct Option
00040     {
00043       static const char* CONST;
00044 
00047       static const char* CHPI;
00048 
00051       static const char* HB;
00052 
00055       static const char* VDW;
00056 
00059       static const char* POLAR;
00060 
00061     };
00062 
00063 
00066     struct Default
00067     {
00068 
00071       static const float CONST;
00072 
00075       static const float CHPI;
00076 
00079       static const float HB;
00080 
00083       static const float VDW;
00084 
00087       static const float POLAR;
00088 
00089     };
00090 
00091 
00092 
00094 
00097 
00098     BALL_CREATE(SLICKScore)
00099 
00100     
00102     SLICKScore()
00103       ;
00104 
00108     SLICKScore(Molecule& protein, Molecule& ligand)
00109       ;
00110 
00113     SLICKScore(Molecule& protein, Molecule& ligand,
00114         const Options& options)
00115       ;
00116 
00119     SLICKScore(const SLICKScore& slick)
00120       ;
00121 
00124     virtual ~SLICKScore()
00125       ;
00126 
00128 
00131 
00134     const SLICKScore& operator = (const SLICKScore& slick)
00135       ;
00136 
00139     virtual void clear()
00140       ;
00141 
00143 
00146 
00149     virtual bool specificSetup()
00150       throw();
00151 
00153 
00156 
00159     double getVDWScore() const
00160       ;
00161 
00164     double getCHPIScore() const
00165       ;
00166 
00169     double getPolarSolvationScore() const
00170       ;
00171 
00174     double getNonpolarSolvationScore() const
00175       ;
00176 
00179     double getHydrogenBondScore() const
00180       ;
00182 
00183 
00184     private:
00185 
00186     /*_
00187     */
00188     void registerComponents_()
00189       ;
00190 
00191   };
00192 
00193 } // namespace BALL
00194 
00195 #endif // BALL_SCORING_FUNCTIONS_SLICKSCORE_H