slickEnergy.h

Go to the documentation of this file.
00001 // $Id: slickEnergy.h,v 1.4 2006/05/21 18:15:28 anker Exp $
00002 
00003 #ifndef BALL_SCORING_FUNCTIONS_SLICKENERGY_H
00004 #define BALL_SCORING_FUNCTIONS_SLICKENERGY_H
00005 
00006 #ifndef BALL_COMMON_H
00007 # include <BALL/common.h>
00008 #endif
00009 
00010 #ifndef BALL_MOLMEC_COMMON_SCORING_FUNCTION_H
00011 # include <BALL/SCORING/COMMON/scoringFunction.h>
00012 #endif
00013 
00014 #ifndef BALL_KERNEL_SYSTEM_H
00015 # include <BALL/KERNEL/system.h>
00016 #endif
00017 
00018 #ifndef BALL_DATATYPE_HASHMAP_H
00019 # include <BALL/DATATYPE/hashMap.h>
00020 #endif
00021 
00022 namespace BALL 
00023 {
00027   class SLICKEnergy
00028     : public ScoringFunction
00029   {
00030 
00031     public:
00032 
00036 
00039     struct Option
00040     {
00043       static const char* CONST;
00044 
00047       static const char* CHPI;
00048 
00051       static const char* HB;
00052 
00055       static const char* VDW;
00056 
00059       static const char* NONPOLAR;
00060 
00063       static const char* POLAR;
00064 
00065     };
00066 
00067 
00070     struct Default
00071     {
00074       static const float CONST;
00075 
00078       static const float CHPI;
00079 
00082       static const float HB;
00083 
00086       static const float VDW;
00087 
00090       static const float NONPOLAR;
00091 
00094       static const float POLAR;
00095 
00096     };
00097 
00098 
00099 
00101 
00104 
00105     BALL_CREATE(SLICKEnergy)
00106 
00107     
00109     SLICKEnergy()
00110       ;
00111 
00115     SLICKEnergy(Molecule& protein, Molecule& ligand)
00116       ;
00117 
00120     SLICKEnergy(Molecule& protein, Molecule& ligand,
00121         const Options& options)
00122       ;
00123 
00126     SLICKEnergy(const SLICKEnergy& slick)
00127       ;
00128 
00131     virtual ~SLICKEnergy()
00132       ;
00133 
00135 
00138 
00141     const SLICKEnergy& operator = (const SLICKEnergy& slick)
00142       ;
00143 
00146     virtual void clear()
00147       ;
00148 
00150 
00153 
00156     virtual bool specificSetup()
00157       throw();
00158 
00160 
00163 
00166     double getCHPIScore() const
00167       ;
00168 
00171     double getHydrogenBondScore() const
00172       ;
00173 
00176     double getVDWScore() const
00177       ;
00178 
00181     double getPolarSolvationScore() const
00182       ;
00183 
00186     double getNonpolarSolvationScore() const
00187       ;
00189 
00190 
00191     private:
00192 
00193     /*_
00194     */
00195     void registerComponents_()
00196       ;
00197 
00198   };
00199 
00200 } // namespace BALL
00201 
00202 #endif // BALL_SCORING_FUNCTIONS_SLICKENERGY_H