kplsModel.h

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// vi: set ts=2:
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//

#ifndef BALL_QSAR_KPLSMODEL_H
#define BALL_QSAR_KPLSMODEL_H

#ifndef BALL_QSAR_KERNELMODEL_H
#include <BALL/QSAR/kernelModel.h>
#endif

#ifndef BALL_QSAR_NONLINEARMODEL_H
#include <BALL/QSAR/nonlinearModel.h>
#endif

#ifndef BALL_QSAR_LATENTVARIABLEMODEL_H
#include <BALL/QSAR/latentVariableModel.h>
#endif

namespace BALL
{
  namespace QSAR
  {
    class BALL_EXPORT KPLSModel : public KernelModel, public LatentVariableModel
    {
      public:
        KPLSModel(const QSARData& q, int k_type, double p1, double p2=-1);
        
        KPLSModel(const QSARData& q, Eigen::VectorXd& w);
        
        KPLSModel(const QSARData& q, String s1, String s2);
        
        KPLSModel(const QSARData& q, const LinearModel& lm, int column);

        ~KPLSModel();

        EIGEN_MAKE_ALIGNED_OPERATOR_NEW
        
        
        
        void train();
        
        bool optimizeParameters(int k, int no_steps);
        
        int getNoComponents();
        
        void setNoComponents(int d);
        
        const Eigen::MatrixXd* getU();
        
        void setParameters(vector<double>& v);
        
        vector<double> getParameters() const;
        
        
      protected:
        Eigen::MatrixXd U_;
        
        int no_components_;
        
    };
  }
}

#endif // KPLSMODEL