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• paintGL() : BALL::VIEW::Scene
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• Pair6_12RDFIntegrator() : BALL::Pair6_12RDFIntegrator
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• ParsedFunction() : BALL::ParsedFunction< arg >
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• PeptideBuilder() : BALL::Peptides::PeptideBuilder
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• persistentWrite() : BALL::Composite , BALL::PersistentObject , BALL::NamedProperty , BALL::PDBInfo , BALL::PDBRecords , BALL::Atom , BALL::AtomContainer , BALL::Bond , BALL::Chain , BALL::Fragment , BALL::Molecule , BALL::NucleicAcid , BALL::Nucleotide , BALL::PDBAtom , BALL::Protein , BALL::Residue , BALL::SecondaryStructure , BALL::System , BALL::TVector2< T > , BALL::CrystalInfo
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• PositiveVdWSurface() : BALL::PositiveVdWSurface
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• PostOrderFolding() : BALL::GRAPH::PostOrderFolding< Tree, From, To, Functor >
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• PredictionConfiguration() : BALL::QSAR::PredictionConfiguration
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• PreferencesEntry() : BALL::VIEW::PreferencesEntry
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• prepareGridTextures() : BALL::VIEW::RenderSetup , BALL::VIEW::Scene
• prepareRendering() : BALL::VIEW::RenderTarget , BALL::VIEW::RenderWindow< taPixelDatatype > , BALL::VIEW::GLOffscreenTarget
• prepareUpscaling() : BALL::VIEW::GLOffscreenTarget
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• prependChild() : BALL::Composite
• preProcessing() : BALL::RSComputer , BALL::SESTriangulator , BALL::SolventAccessibleSurface , BALL::SESComputer
• PrincipalMomentOfInertia() : BALL::PrincipalMomentOfInertia
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• printEnergy() : BALL::EnergyMinimizer
• printMatrix() : BALL::QSAR::QSARData
• printParameters_() : BALL::EmpiricalHSShiftProcessor , BALL::HBondShiftProcessor , BALL::HaighMallionShiftProcessor , BALL::EFShiftProcessor
• printScene() : BALL::VIEW::Scene
• printSelectionInfos() : BALL::VIEW::MainControl
• printTargets_() : BALL::EmpiricalHSShiftProcessor , BALL::HaighMallionShiftProcessor , BALL::HBondShiftProcessor , BALL::EFShiftProcessor
• printUCK() : BALL::UCK
• pro_pressed() : BALL::VIEW::PeptideDialog
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• probeRadiusChanged() : BALL::VIEW::ModelSettingsDialog
• proceed() : BALL::DockingAlgorithm
• processEvent_() : BALL::VIEW::TestFramework
• processEvents() : BALL::VIEW::MainControl
• processMoveModeMouseEvents_() : BALL::VIEW::Scene
• processRotateModeMouseEvents_() : BALL::VIEW::Scene
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• projectionTransformationChanged() : BALL::VIEW::StageSettings
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• prolineDeactivated() : BALL::VIEW::PeptideDialog
• PropDeleteWidget() : BALL::VIEW::PropDeleteWidget
• PropEditorWidget() : BALL::VIEW::PropEditorWidget
• PropertiesForShift_() : BALL::EmpiricalHSShiftProcessor::PropertiesForShift_
• Property() : BALL::SmartsParser::SPAtom::Property
• PropertyEditor() : BALL::VIEW::PropertyEditor
• PropertyError() : BALL::QSAR::Exception::PropertyError
• PropertyManager() : BALL::PropertyManager
• Protein() : BALL::Protein
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• proxyModeChanged() : BALL::VIEW::NetworkPreferences
• prune() : BALL::TreeWidthImplementation< EditableGraph >::QuickBB< Lowerbound, Upperbound >
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• PTEDialog() : BALL::VIEW::PTEDialog
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• put() : BALL::XDRPersistenceManager , BALL::TextPersistenceManager , BALL::XDRPersistenceManager , BALL::TextPersistenceManager , BALL::XDRPersistenceManager , BALL::TextPersistenceManager , BALL::PersistenceManager , BALL::TextPersistenceManager , BALL::PersistenceManager , BALL::TextPersistenceManager , BALL::XDRPersistenceManager , BALL::PersistenceManager , BALL::XDRPersistenceManager , BALL::PersistenceManager , BALL::XDRPersistenceManager , BALL::PersistenceManager , BALL::TextPersistenceManager , BALL::PersistenceManager , BALL::XDRPersistenceManager , BALL::TextPersistenceManager , BALL::XDRPersistenceManager
• putbackLine() : BALL::QSAR::ConfigIO
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• PyCompositeList() : BALL::PyCompositeList
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