- p -

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• paintEvent() : BALL::VIEW::ColorButton , BALL::VIEW::GLRenderWindow , BALL::VIEW::Scene , BALL::VIEW::SDWidget , BALL::VIEW::TextEditorWidget::LineNumbers
• paintGL() : BALL::VIEW::Scene
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• Pair6_12RDFIntegrator() : BALL::Pair6_12RDFIntegrator
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• ParsedFunction() : BALL::ParsedFunction< arg >
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• Path() : BALL::Path
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• peelRings_() : BALL::RingAnalyser
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• pentakisDodecaeder() : BALL::TriangulatedSphere
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• PeptideBuilder() : BALL::Peptides::PeptideBuilder
• PeptideCapProcessor() : BALL::PeptideCapProcessor
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• persistentWrite() : BALL::Atom , BALL::AtomContainer , BALL::Bond , BALL::Chain , BALL::Composite , BALL::CrystalInfo , BALL::Fragment , BALL::Molecule , BALL::NamedProperty , BALL::NucleicAcid , BALL::Nucleotide , BALL::PDBAtom , BALL::PDBInfo , BALL::PDBRecords , BALL::PersistentObject , BALL::Protein , BALL::Residue , BALL::SecondaryStructure , BALL::System , BALL::TVector2< T > , BALL::VIEW::Stage::Material
• PharmacophoreConstraint() : BALL::PharmacophoreConstraint
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• PierottiCavFreeEnergyProcessor() : BALL::PierottiCavFreeEnergyProcessor
• PixelFormat() : BALL::VIEW::PixelFormat
• PixmapItem() : BALL::VIEW::CanvasWidget::PixmapItem
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• PLPScoring() : BALL::PLPScoring
• PLSModel() : BALL::QSAR::PLSModel
• pluginChanged() : BALL::VIEW::PluginDialog
• PluginDialog() : BALL::VIEW::PluginDialog
• PluginDirectoryModel() : BALL::VIEW::PluginDirectoryModel
• PluginManager() : BALL::PluginManager
• PluginModel() : BALL::VIEW::PluginModel
• pluginsLoaded() : BALL::VIEW::PluginModel
• Point() : BALL::VIEW::Point
• Polarity() : BALL::Polarity
• PolarSolvation() : BALL::PolarSolvation
• PolarVdWSurface() : BALL::PolarVdWSurface
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• populateContextMenu() : BALL::VIEW::EditMode , BALL::VIEW::InteractionMode , BALL::VIEW::InteractionModeManager , BALL::VIEW::MoveMode
• PoseClustering() : BALL::PoseClustering
• PosePointer() : BALL::PoseClustering::PosePointer
• PositionColorProcessor() : BALL::VIEW::PositionColorProcessor
• positionTypeChanged() : BALL::VIEW::LightSettings
• PositivePolarVdWSurface() : BALL::PositivePolarVdWSurface
• PositiveVdWSurface() : BALL::PositiveVdWSurface
• Postcondition() : BALL::Exception::Postcondition
• postorder() : BALL::FPTBondOrderStrategy::DPBackTracking_ , BALL::GRAPH::PostOrderFolding< Tree, From, To, Functor >
• PostOrderFolding() : BALL::GRAPH::PostOrderFolding< Tree, From, To, Functor >
• postProcessAtomTypes_() : BALL::GAFFTypeProcessor
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• postprocessRandomCoils_() : BALL::PDBFile
• postprocessSheetsTurns_() : BALL::PDBFile
• postprocessSSBonds_() : BALL::PDBFile
• Potential1210() : BALL::Potential1210
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• POVFinish() : BALL::VIEW::POVRenderer
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• POVVector3() : BALL::VIEW::POVRenderer
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• PreciseTime() : BALL::PreciseTime
• precisionBoxChanged() : BALL::VIEW::DisplayProperties
• precisionSliderChanged() : BALL::VIEW::DisplayProperties
• precomputeAtomBijection_() : BALL::PoseClustering
• precomputeAtomProperties_() : BALL::GAFFTypeProcessor
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• precomputeBondProperties_() : BALL::GAFFTypeProcessor
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• Precondition() : BALL::Exception::Precondition
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• PredictionConfiguration() : BALL::QSAR::PredictionConfiguration
• Preferences() : BALL::VIEW::Preferences
• PreferencesEntry() : BALL::VIEW::PreferencesEntry
• PreferencesObject() : BALL::PreferencesObject
• preorder() : BALL::FPTBondOrderStrategy::DPBackTracking_ , BALL::GRAPH::PostOrderFolding< Tree, From, To, Functor >
• prepare() : BALL::StructurePreparer
• prepare_() : BALL::SDGenerator
• prepareBufferedRendering() : BALL::VIEW::BufferedRenderer , BALL::VIEW::CudaVolumeRenderer , BALL::VIEW::RTfactRenderer
• prepareGridTextures() : BALL::VIEW::RenderSetup , BALL::VIEW::Scene
• prepareRendering() : BALL::VIEW::GLOffscreenTarget , BALL::VIEW::RenderTarget , BALL::VIEW::TRenderWindow< taPixelDatatype >
• prepareUpscaling() : BALL::VIEW::GLOffscreenTarget
• prepend() : BALL::AtomContainer , BALL::Chain , BALL::Molecule , BALL::Nucleotide , BALL::Residue , BALL::SecondaryStructure , BALL::System
• prependChild() : BALL::Composite
• PrincipalMomentOfInertia() : BALL::PrincipalMomentOfInertia
• PrincipalMomentOfInertiaX() : BALL::PrincipalMomentOfInertiaX
• PrincipalMomentOfInertiaY() : BALL::PrincipalMomentOfInertiaY
• PrincipalMomentOfInertiaZ() : BALL::PrincipalMomentOfInertiaZ
• print() : BALL::VIEW::PixelFormat
• printAPS() : BALL::GAFFCESParser::APSMatcher
• printCluster_() : BALL::PoseClustering
• printClusters() : BALL::PoseClustering
• printClusterScores() : BALL::PoseClustering
• printCursorPosition_() : BALL::VIEW::PyWidget
• printEnergy() : BALL::EnergyMinimizer
• printFragments() : BALL::IMGDock
• printHelp() : BALL::CommandlineParser
• printMatrix() : BALL::QSAR::QSARData , BALL::ScoringOptimizer
• printResult() : BALL::GridBasedScoring , BALL::ScoringFunction
• printResults() : BALL::IMGDock
• printScene() : BALL::VIEW::Scene
• printSelectionInfos() : BALL::VIEW::MainControl
• printToolInfo() : BALL::CommandlineParser
• printUCK() : BALL::UCK
• printVariables_() : BALL::PoseClustering
• pro_pressed() : BALL::VIEW::PeptideDialog
• probeRadiusChanged() : BALL::VIEW::ModelSettingsDialog
• proceed() : BALL::DockingAlgorithm
• processEvent_() : BALL::VIEW::TestFramework
• processEvents() : BALL::VIEW::MainControl
• processMoveModeMouseEvents_() : BALL::VIEW::MoveMode
• processMultiMoleculeFile() : BALL::DockingAlgorithm
• processRotateModeMouseEvents_() : BALL::VIEW::RotateMode
• Product() : BALL::Product< First, Second, DataType >
• projectionModeChanged() : BALL::VIEW::RenderSetup , BALL::VIEW::Scene
• prolineActivated() : BALL::VIEW::PeptideDialog
• prolineDeactivated() : BALL::VIEW::PeptideDialog
• PropDeleteWidget() : BALL::VIEW::PropDeleteWidget
• PropEditorWidget() : BALL::VIEW::PropEditorWidget
• PropertiesForShift_() : BALL::EmpiricalHSShiftProcessor::PropertiesForShift_
• Property() : BALL::SmartsParser::SPAtom::Property
• PropertyEditor() : BALL::VIEW::PropertyEditor
• PropertyError() : BALL::QSAR::Exception::PropertyError
• PropertyManager() : BALL::PropertyManager
• Protein() : BALL::Protein
• ProteinIteratorTraits() : BALL::ProteinIteratorTraits
• protomode() : BALL::VIEW::ExportGeometryDialog
• proxyEnabled() : BALL::VIEW::NetworkPreferences
• proxyModeChanged() : BALL::VIEW::NetworkPreferences
• prune() : BALL::TreeWidthImplementation< EditableGraph >::QuickBB< Lowerbound, Upperbound >
• PTE_() : BALL::PTE_
• PTEDialog() : BALL::VIEW::PTEDialog
• PubChemDialog() : BALL::VIEW::PubChemDialog
• PubChemDownloader() : BALL::PubChemDownloader
• push() : BALL::RingPerceptionProcessor::PathMessage_
• push_back() : BALL::PDBRecords , BALL::String
• pushbackNCS() : BALL::CrystalInfo
• pushBackNormal() : BALL::TSurface< T >
• pushBackTriangle() : BALL::TSurface< T >
• pushBackVertex() : BALL::TSurface< T >
• pushCFS_() : BALL::SDGenerator
• put() : BALL::PersistenceManager , BALL::TextPersistenceManager , BALL::XDRPersistenceManager
• putbackLine() : BALL::QSAR::ConfigIO
• PyColorRGBAVector() : BALL::PyColorRGBAVector
• PyCompositeList() : BALL::PyCompositeList
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• PyIndexList() : BALL::PyIndexList
• PythonHighlighter() : BALL::VIEW::PythonHighlighter
• PythonSettings() : BALL::VIEW::PythonSettings
• PythonValidator() : BALL::VIEW::PythonValidator
• PyWidget() : BALL::VIEW::PyWidget